2015年，我院国家自然科学基金中标24项，其中青年基金15项、面上项目9项，获得总经费960万元，中标率28.9%，较2014年中标数量翻番；国家中医药管理局中医药行业科研专项项目2项，获得经费298万元；江苏省科技厅各类项目中标11项，比去年增长71.4%，其中，省创新能力建设计划（科技设施类）项目1项，省社会发展——重点病种规范化诊疗项目1项，省自然基金项目9项（面上项目3项，青年项目6项），获得科研总费1150万元；江苏省中医药局科技项目中标19项，其中重点项目3项，一般项目16项，获得科研经费76万元。省级以上拨款科研总经费较去年增长71.7%。
近年我院获得纵向项目呈现三个显著特点。一是获资助项目数量大幅增加。近五年，我院获得国家基金项目数量保持持续增长，从2010年的2项，增加到今年的24项；二是学科平衡发展。在保持中药学科中标率增长同时，临床中医学和中西医结合学科国自然中标数实现快速增长；三是年龄结构更趋合理。获资助项目负责人年龄在35岁以下的占58.3%，40岁及以下的占66.7%，青年科研人员科研水平快速增强。
作为省级科研院所，科研工作一直是我院的重点工作，近年来，单位坚持对科研项目实行制度化、科学化的管理。不断加强学术梯队建设，特别是加大青年科研、临床人员的培养。通过设立青年基金项目、加大院内预研项目资助力度等措施，有效地调动全院各科室参与科研的热情。2015年从申报关抓起，实施项目申报“个体化服务”，一是组织多种形式多层次政策宣讲与解读；二是邀请中国中医科学院等国内各学科知名专家进行专题报告近10场；三是临床科室与基础科研人员相互协作，共同撰写标书，并组织有针对性的申报项目点评。项目申请书质量大幅提升，为助力单位内涵发展，增强原始创新驱动能力，奠定更加坚实的科学基础。